在北極圈建造了要塞「蛇牙城」的瘋狂科學家「蘭度博士」向全世界發出宣言，要將整個世界據為己有。為了應對這樣的情況，原蓋塔隊成員之一，同時也是NISER司令官的神隼人召集一文字號、橘翔、大道剴三人組成了新的蓋塔隊，駕駛新型的蓋塔機器人挺身對抗蘭度博士的大軍。新一代蓋塔隊與原蓋塔隊成員們的新故事就此展開！本作是蓋塔SAGA系列正統續作，時間軸在《蓋塔機器人(初代）》和《真蓋塔機器人》之後。